4 травня 2010

Біологи із США та Канади представили новий ефективний спосіб "виключення" генів нематоди Caenorhabditis elegans.
C. elegans, вільноживуча нематода, довжиною до 1 мм, стала першим багатоклітинним організмом із повністю секвенованим геномом. Для того щоб встановити функції кожного із 20 160 генів нематоди, необхідний надійний метод їх руйнування.
Розроблену технологію автори назвали MosDel, що розшифровується як Mos1-mediated deletion - видалення за допомогою транспозону Mos1. Транспозонами, або "стрибаючими генами", називають послідовності ДНК, здатні переміщатися всередині геному і вбудовуватися в нього на різних ділянках. Mos1 кодує фермент транспозазу, який і забезпечує "розрізання" ДНК.
Суть методу полягає у видаленні Mos1, розташованого поряд із геном, що "виключається", за допомогою транспозази Mos1, ген якої доставляється спеціальною плазмідою. Утворений розрив повинен усуватися природним шляхом із використанням непошкодженої хромосоми в якості зразка, але вчені впроваджують власний шаблон, у якому послідовність, що відповідає зруйнованому гену, відсутня.
У процесі відновлення пошкоджень видаляється до 25 тис. пар основ на ділянці, прилеглій до місця включення Mos1. Довжина генів нематод становить від 700 до 30 тис. пар основ, а середнє її значення оцінюється 5 тис. пар основ. За словами дослідників, технологія забезпечує видалення 20 043 генів, або 99,4% від їх загального числа. Так само можна діяти і в експериментах із деякими іншими широко використовуваними в біології організмами (наприклад, плоскими червами і рибками даніо реріо), але для ссавців із їх довгими генами 25 тис. пар основ буде недостатньо.
Крім того, новий метод дозволяє вводити так звані маркери позитивної селекції, які спрощують задачу експериментаторів. У одному досліді вчені, наприклад, працювали із нематодами, у яких було порушено функціонування гену unc-119; такі зміни призводять до смерті C. elegans, але вчені, видаливши ген, одночасно внесли робочу копію unc-119, і нематоди залишилися живими.
Діючи подібним чином, автори зуміли "виключити" 10 різних генів.
Повна версія звіту буде опублікована в журналі Nature Methods.

Ресурс: http://www.mma.ru/news/id59184