8 грудня 2009

Результати дослідження вчених із Університету Брандейс (США) дозволяють отримати нову важливу інформацію про поведінку білків на атомно-молекулярному рівні.
Уперше комплексне дослідження біологічно активних молекул методами рентгеноструктурного аналізу і ядерного магнітного резонансу дозволило безпосередньо визначити і візуалізувати структури білків, що знаходяться у ключових станах для процесу ферментативного каталізу і відповідають метастабільним рівновагам на координаті реакції. Дослідження дозволяє визначити, яким чином молекулярний рух білків у цих прихованих станах впливає на процес ферментативного каталізу. Результати дослідження дозволяють знайти нові фрагменти білків-ферментів, які б могли виступати в ролі молекулярних мішеней для потенційних ліків. Дослідження подібного роду є наріжним каменем для спрямованої розробки нових фармацевтичних препаратів.
Ліки можуть зв’язуватися або стикатися із метастабільними третинними структурами ферментів-мішеней; ці незначні зміни третинної структури практично неможливо визначити традиційними методами. Дослідники вважають, що більш ефективне блокування ферментів-мішеней може бути досягнуте на основі вивчення механізму зіткнення ліків із цілим набором структур одного і того ж білка, а не із його одиничним станом.
Нове дослідження представляє собою логічне продовження попередніх робіт біохіміків із Університету Брандейс, спрямованих на детальне вивчення функцій білкових молекул за допомогою методів ЯМР. Тривалий час дослідники вважали, що зміни третинної структури білків-каталізаторів реалізуються лише безпосередньо в процесі каталітичного акту і направлені на організацію будови активного центру фермента, необхідну для розпізнавання субстрату.
Декілька років тому назад Дороті Керн за допомогою метода ЯМР встановила, що деякі білки можуть переходити у метастабільні енергетичні стани і в тому випадку, коли білок не виконує каталітичні функції, але “рисунки ”, які відображають третинні структури білків у цих станах ще не були отримані.
У новій роботі Керн повідомляє, що їй вдалося досягти нового рівня у розумінні поведінки білків, вперше отримавши рисунок із високою розрішуючою здатністю, що описує третинну структуру білка, яку він набуває у метастабільному енергетичному стані.
Ресурс: http://www.chemport.ru/datenews.php?news=1935